Деформация социально-экономического развития регионов является одной из самых острых проблем современной России. Структурная диспропорция в развитии наблюдается и на уровне муниципальных образований. От стабильного развития муниципальных образований зависит устойчивое развитие региональной экономики и соответственно российской экономики в целом. Результатом увеличения диспропорций в социально-экономическом развитии муниципальных образований внутри одного региона становится непропорциональное развитие проблемных муниципалитетов с постоянным увеличением уровня их дотационности, приводит к проблемам при формировании инвестиционной,бюджетной политики, планировании развития социальной, экономической сферы региона. В этой связи исследование вопросов, связанных с эффективностью управления социально - экономическим развитием территорий на основе разработки методических подходов к оценке сбалансированного развития муниципальных образований региона, обуславливает актуальность темы исследования.