Только в 1924 году тюрьма Трубецкого бастиона была окончательно закрыта и превращена в музей - филиал Музея революции. Экскурсии по музею нередко водили бывшие заключенные. В 1954 году тюрьма Трубецкого бастиона вместе с другими постройками Петропавловской крепости была передана Государственному музею истории Ленинграда, и в 1964 году здесь начала действовать экспозиция. В 2008 году, к 100-летию Государственного музея истории Санкт-Петербурга, после ремонта в помещениях Трубецкого бастиона открылась новая экспозиция, рассказывающая об истории и узниках главной политической тюрьмы России.