Тяжелые времена вновь пришли в систему Lylat. Разразилась новая война, люди, города и культура под угрозой полного уничтожения. Единственная возможность спастись, команда Star Fox, но члены команды пошли разными путями. Доблестный Fox McCloud единственная надежда, без поддержки друзей он вступает в битву. Но что он может один? Ему предстоит долгий и тяжелый путь, но награда покроет все.