Krang und Shredder geben nie auf. Diesmal wollen sie den gigantopower Trilithium-Kristall stehlen, um ihr Technodrom mit Energie zu versorgen. Die Wachroboter werden umgepolt und auf einmal haben es unsere grünen Helden nicht nur mit den intergalaktischen Fieslingen, sondern auch mit einer Armee von ausgerasteten Soldaten-Klons zu tun. Jetzt müssen sich die tapferen Teenage-Mutanten etwas einfallen lassen...